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La ville de Cotonou est confrontée à des problèmes d’assainissement depuis des décennies. Les eaux usées sont rejetées dans les espaces vides, dans la rue et dans les caniveaux par les populations. Cette recherche vise à étudier l’impact de la mauvaise gestion des eaux usées sur l’environnement dans le 5éme arrondissement de Cotonou. Pour aboutir à ce constat, un échantillonnage a été effectué. La technique d’échantillonnage à choix raisonné aléatoire a été retenue. Les données ont été collectées auprès de 295 personnes, incluant des ménages, des vendeuses de nourriture et les agents d’assainissement dans les hôpitaux. D’après les résultats, cette mauvaise gestion des eaux usées a des conséquences graves sur l’environnement par la pollution et la dégradation du sol, la contamination des eaux souterraines, le pourri qui flotte dans l’air, la contamination et la pollution de la lagune de Cotonou. Vu la gravité de la situation, il faut des campagnes de conscientisation, l’aménagement de réseaux d'assainissement adaptés et l’élaboration d’un cadre réglementaire solide et la répression pour la gestion des eaux usées. Mots clés : Lagune de Cotonou, pollution, eaux usées, santé humaine, environnement.